五、法院判決後修改法律
廣州市當局後來拘捕了喬燕琴等十多名涉案人士，並於同年6月9日一審判決主犯喬燕琴死刑，第二主犯李海櫻被判處死刑，緩期兩年執行;其餘十名罪犯分別被判處有期徒刑三年至無期徒刑。另有六名有關官員因而被控瀆職罪，判監一至三年。
此外，在孫志剛案庭審時，一位病人檢舉說，他親眼看見209房有人被打死。公安機關調查的結果證實，從3月16日到3月19日，救治區共有3人死亡。其中兩人屬於病死，一人是“頭部挫傷，顱內出血”。這個死亡名單中尚不包括孫志剛。由於此次受害者身亡，並且其身分不是流浪漢而是大學生，因而產生極大影響。許多媒體詳細報導了此一事件，並曝光了許多同一性質的案件，在社會上掀起了對收容遣送制度的大討論。先後有8名學者上書全國人大，要求就此對收容遣送制度進行違憲審查。
因一個人的死亡而引發國務院出台了新的《城市生活無著的流浪乞討人員救助管理辦法》。從“收容”變“救助”，湖北青年孫志剛付出了生命的代價——一個自由公民，在自己的國家因為沒有攜帶證件而被活活打死。在媒體和學界關注下，國務院出台了新的《城市生活無著的流浪乞討人員救助管理辦法》。舊制度開始鬆動，但是暴露出的城鄉二元結構對立、公民自由遷徙權、違憲審查機制等問題，還需要更長時間的努力。
