1996年吳毅將與李麗珍、駱達華、舒淇、徐錦江等主演三級片《玉蒲團之玉女心經》，在電影裡扮演中毒的捕頭；隨後又與陳妙瑛、李麗珍、莫文蔚等主演動作片《古惑女之決戰江湖》，飾演洛威拿；接著又與莫少聰、彭丹、徐錦江等主演電影《危險任務》。 最後又與郭富城、朱茵等主演了時裝電視劇《廉政行動組》，飾演遊樂生。 1997年吳毅將與元華、陳妙瑛等主演由莊偉建監製的電視劇《男人四十打功夫》，飾演江智勇。
1998年吳毅將參演由劉德華、關秀媚、梁詠琪主演的動作片《龍在江湖》，飾演Crazy Ball。 1999年吳毅將與陳浩民、洪天明、邵美琪等主演時裝警匪片《反黑先鋒》，飾演反黑組幹探高喜。隨後又與張家輝、關秀媚、黃秋生、朱茵等主演三級片《強姦終極篇之最後羔羊》，飾演DANIEL。 2001年吳毅將主演由廣東電視台主拍的電視劇《驚天鐵案》，劇中他飾演張子強。 2004年吳毅將友情出演由謝君豪、王璐瑤、馬蒂尼等主演的傳奇歷史劇《鐵血蓮花》，飾演杜海龍。 2007年吳毅將參演由鄭伊健、陳小春等主演的新版《霍元甲》，飾演大刀王五。 2008年吳毅將與陳浩民、何中華等主演“水滸人物”系列數字電影《小李廣花榮》，飾演雷震。 2009年吳毅將與焦恩俊、孫海英等主演古裝歷史劇《大將軍韓信》（又名《戰神韓信》），飾演項羽。
2010年吳毅將參演由邱澤、貢米等主演的古裝神話劇《聊齋3》，飾演居士清水；接著又在考古抗日情感戲《第四片甲骨》中飾演女一號"三小姐"的父親、盜墓賊胡鐵成。 北京熱麥國際傳媒有限公司《海島七號》海島救護隊（邱勝翊）林爽三浦貴大馬羚劉惠勵志電影《極速先鋒》 2012年吳毅將參演古裝歷史傳奇劇《大唐女將樊梨花》，與苗皓鈞分別飾演深有謀略，文武雙全的大將薛仁貴額程咬金，這也是兩人繼電視劇《海島七號》之後的再度合作。5月，參演由吳奇隆、馬蘇、樊少皇、李解、劉思彤、郭珍霓、葉祖新、張天其等主演的古裝武俠劇《新白髮魔女傳》，飾演慕容沖。 2013年吳毅將與白微、任天野共同主演鐵血青春軍旅劇《8848》，飾演獨臂老大。 2017年7月，參演電視劇《許你浮生若夢》。
